По време на представянето на предстоящия си 50-ти филм Уди Алън обяви, че прекратява режисьорската си кариера. Алън заяви пред испанския вестник La Vanguardia, че възнамерява да се оттегли от заниманието си да снима филми и да посвети повече време на писането.
Отказът му от режисьорското поприще в Европа се случва в момент, когато подкрепата му в Съединените щати рязко спада, предвид обвиненията в злоупотреба срещу него. Действието на последния му филм " Wasp 22” се развива в Париж и ще бъде заснет изцяло на френски език и завършен след няколко седмици. Алън описва сюжета като "отровен романтичен трилър".
Алън режисира първия си пълнометражен филм „What’s Up, Tiger Lily?” през 1966 година. Почти десетилетие по-късно той заснема хитовия филм "Ани Хол", който го изстрелва в редиците на майсторите зад камерата. Алън е номиниран за 24 награди "Оскар" и печели четири от тях.
По време на плодотворната си кариера той винаги е бил в центъра на спорове и клюки. През 1997 г. се жени за Сун-И Превин - дете на бившата му приятелка Миа Фароу. Оттам се появяват множество обвинения в сексуално насилие, свързани с децата на Миа Фароу. Твърденията привличат значително медийно внимание, но Алън никога не е бил обвиняван или преследван и винаги е отхвърлял обвиненията
